インタラクティブな R セッションの使用可能なメモリを管理するために、人々はどのようなトリックを使用しているのでしょうか。私は、以下の関数 (2004 年の r-help リストへの Petr Pikal と David Hinds の投稿に基づく) を使用して、最大のオブジェクトを一覧表示 (および/または並べ替え) し、場合によってはrm()
その一部を表示します。しかし、これまでのところ、最も効果的な解決策は、十分なメモリを備えた 64 ビット Linux で実行することです。
他にも共有したい便利なコツはありますか? 投稿ごとに 1 つずつお願いします。
# improved list of objects
.ls.objects <- function (pos = 1, pattern, order.by,
decreasing=FALSE, head=FALSE, n=5) {
napply <- function(names, fn) sapply(names, function(x)
fn(get(x, pos = pos)))
names <- ls(pos = pos, pattern = pattern)
obj.class <- napply(names, function(x) as.character(class(x))[1])
obj.mode <- napply(names, mode)
obj.type <- ifelse(is.na(obj.class), obj.mode, obj.class)
obj.size <- napply(names, object.size)
obj.dim <- t(napply(names, function(x)
as.numeric(dim(x))[1:2]))
vec <- is.na(obj.dim)[, 1] & (obj.type != "function")
obj.dim[vec, 1] <- napply(names, length)[vec]
out <- data.frame(obj.type, obj.size, obj.dim)
names(out) <- c("Type", "Size", "Rows", "Columns")
if (!missing(order.by))
out <- out[order(out[[order.by]], decreasing=decreasing), ]
if (head)
out <- head(out, n)
out
}
# shorthand
lsos <- function(..., n=10) {
.ls.objects(..., order.by="Size", decreasing=TRUE, head=TRUE, n=n)
}
ベストアンサー1
再現可能なスクリプトで作業を記録するようにしてください。時々、R を再度開いてからsource()
スクリプトを開いてください。使用していないものはすべて削除され、さらにコードをテストすることもできます。