10個の.bamファイル(生物情報形式)があり、それを10個の.bedファイルに変換したいのですが、この変換には特別なコマンドを使用する必要があります。
bedtools bamTobed -i (input file) > output file.bed
ベストアンサー1
あなたの質問は明確ではありませんが、このシェルコマンドは役に立ちます。
for x in *.bam; do
bedtools bamTobed -i "$x" >"${x%.bam}.bed"
done