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ファイルBをAと比較し、awk、sed、またはgrepを使用してAからデータを抽出します。

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ファイルBをAと比較し、awk、sed、またはgrepを使用してAからデータを抽出します。

ファイルAにはすべてのデータが含まれ、他のファイルBにはIDのみが含まれる2つのファイルがあります。私が望むのは、ファイルBをファイルAと比較し、そのIDのデータを取得することです。私はSUSE Linuxを使用しています。

ファイルA

C    02020 Two-component system [PATH:aap02020]
D      NT05HA_1798 sensor protein CpxA  
D      NT05HA_1797 CpxR K07662 cpxR
C    02030 *Bacterial chemotaxis* [PATH:aap02030]
D      NT05HA_0919 maltose-binding periplasmic protein
D      NT05HA_0918 maltose-binding periplasmic protein 
C    03070 *Bacterial secretion system* [PATH:aap03070]
D      NT05HA_1309 protein-export membrane protein SecD 
D      NT05HA_1310 protein-export membrane protein SecF 
D      NT05HA_1819 preprotein translocase subunit SecE
D      NT05HA_1287 protein-export membrane protein  
C    02060 Phosphotransferase system (PTS) [PATH:aap02060]
D      NT05HA_0618 phosphoenolpyruvate-protein 
D      NT05HA_0617 phosphocarrier protein HPr 
D      NT05HA_0619 pts system

文書B

Bacterial chemotaxis
Bacterial secretion system

希望の出力：

C    02030 *Bacterial chemotaxis* [PATH:aap02030]
D      NT05HA_0919 maltose-binding periplasmic protein
D      NT05HA_0918 maltose-binding periplasmic protein 
C    03070 *Bacterial secretion system* [PATH:aap03070]
D      NT05HA_1309 protein-export membrane protein SecD
D      NT05HA_1310 protein-export membrane protein SecF
D      NT05HA_1819 preprotein translocase subunit SecE  
D      NT05HA_1287 protein-export membrane protein

ベストアンサー1

あなたが使用できるawk：

awk 'NR==FNR{         # On the first file,
       a[$0];         # store the content in the array a
       next
     } 
     {                        # On the second file, 
         for(i in a)          # for all element in the array a,
            if(index($0,i)) { # check if there is match in the current record
               print "C" $0   # in that case print it with the record separator
               next
            }
     }' fileB RS='\nC' fileA
C    02030 *Bacterial chemotaxis* [PATH:aap02030]
D      NT05HA_0919 maltose-binding periplasmic protein
D      NT05HA_0918 maltose-binding periplasmic protein 
C    03070 *Bacterial secretion system* [PATH:aap03070]
D      NT05HA_1309 protein-export membrane protein SecD 
D      NT05HA_1310 protein-export membrane protein SecF 
D      NT05HA_1819 preprotein translocase subunit SecE
D      NT05HA_1287 protein-export membrane protein

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