2つのファイルがあります。 File1には遺伝子相互作用（遺伝子記号）があり、他のFile2には遺伝子記号と対応するEnsembl IDがあります。
ファイル1
GeneA GeneB
GeneA GeneD
GeneC GeneB
ファイル2
GeneA Ensembl1
GeneB Ensembl2
GeneC Ensembl3
それでは、以下のような出力を持つファイルFile3が欲しいです。
GeneA Ensembl1 GeneB Ensembl2
GeneA Ensembl1 GeneD NA
GeneC Ensembl3 GeneB Ensembl2
File2 に GeneD がないため、その遺伝子の Ensembl ID が見つからない場合は、その遺伝子に NA が入力されます。誰もが実装するのに役立ちますか？
ベストアンサー1
アッ解決策：
awk 'NR==FNR{ a[$1]=$2; next }
{ $1=$1 FS (($1 in a)? a[$1]:"NA"); $2=$2 FS (($2 in a)? a[$2]:"NA"); }1' File2 File1
出力：
GeneA Ensembl1 GeneB Ensembl2
GeneA Ensembl1 GeneD NA
GeneC Ensembl3 GeneB Ensembl2