次の形式のファイルがあります
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:1114:22047:12565:307
TCCGAAAGT-ACAACGTGT
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:2104:9367:8166:307
TTCGAAAGTT-GGTGAGGTGTGGG
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:1119:11492:8271:307
TCCGAAAGTTCTCCGA-CTTGGCTTCCTAG
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:2111:19039:8200:307
GACGAAAGTTCACCGATA-GAGGTAGAAGGTGCAGTGGGGA
2行目が「-」で区切られた2行に分割され、新しい行に変更され、「>」識別子の前の名前が新しい行にコピーされ、最後に_2に名前が変更されるように、この行を操作して変更したいと思います。 、次のように。
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:1114:22047:12565:307
TCCGAAAGT
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:1114:22047:12565:307_2
ACAACGTGT
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:2104:9367:8166:307
TTCGAAAGTT
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:2104:9367:8166:307_2
GGTGAGGTGTGGG
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:1119:11492:8271:307
TCCGAAAGTTCTCCGA
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:1119:11492:8271:307_2
CTTGGCTTCCTAG
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:2111:19039:8200:307
GACGAAAGTTCACCGATA
>M03117:162:000000000-ATLWF:1:2111:19039:8200:307_2
GAGGTAGAAGGTGCAGTGGGGA
私はこれがawkでできることを知っていますが、どのような方法でもわかりません。
ベストアンサー1
「awkの使い方」について具体的に質問したので
awk -F- '
/^>/ {hdr=$0; next}
{print hdr ORS $1; for(i=2;i<=NF;i++) print hdr"_"i ORS $i}
' file