その後、この結果は、以下のスクリプトでベン図を描画するために使用されます。

その後、この結果は、以下のスクリプトでベン図を描画するために使用されます。

Wienプログラムの次の出力ファイルがあります。

[1, 2],106
[1, 3],2556
[2, 3],5207
[1, 2, 3],232
[2],7566
[3],8840
[1],5320

次のスクリプトで、各行の結果番号を可変引数として取得するには、コマンドが必要です。

$area1=[1]以降の結果でなければならない、$area2=[2]以降の結果でなければならない、$area3=[3]以降の結果でなければならない、$n12=[2]以降の結果でなければならない] 結果。 [1, 2] 以降の結果、 $n13=[1, 3] 以降の結果でなければなりません。 $n23=[2, 3] 以降の結果でなければなりません。 ,3]以降の結果[1,2,3],

その後、この結果は、以下のスクリプトでベン図を描画するために使用されます。

cat << catfile >> $prefix1-VennDiagram.R
library(VennDiagram);
venn.diagram(
    x = list(
        "$sample1" = c(1:$area1, $(($area1+1)):$(($area1+$n12)), $(($area1+$n12+1)):$(($area1+$n12+$n123)), $(($area1+$n12+$n123+1)):$(($area1+$n12+$n123+$n13))),
        "$sample2" = c($(($area1+$n12+$n123+$n13+1)):$(($area1+$n12+$n123+$n13+$area2)), $(($area1+1)):$(($area1+$n12)), $(($area1+$n12+1)):$(($area1+$n12+$n123)), $(($area1+$n12+$n123+$n13+$area2+1)):$(($area1+$n12+$n123+$n13+$area2+$n23))),
        "$sample3" = c($(($area1+$n12+$n123+$n13+$area2+$n23+1)):$(($area1+$n12+$n123+$n13+$area2+$n23+$area3)),  $(($area1+$n12+1)):$(($area1+$n12+$n123)), $(($area1+$n12+$n123+1)):$(($area1+$n12+$n123+$n13)), $(($area1+$n12+$n123+$n13+$area2+1)):$(($area1+$n12+$n123+$n13+$area2+$n23)))
        ),
    filename = "$prefix1-VennDiagram.tiff",
    col = "transparent",
    fill = c("red", "blue", "green"),
    alpha = 0.5,
    label.col = c("darkred", "white", "darkblue", "white", "white", "white", "darkgreen"),
    cex = 2.5,
    fontfamily = "arial",
    fontface = "bold",
    cat.default.pos = "text",
    cat.col = c("darkred", "darkblue", "darkgreen"),
    cat.cex = 2.0,
    cat.fontfamily = "arial",
    cat.fontface = "italic",
    cat.dist = c(0.06, 0.06, 0.03),
    cat.pos = 0
    );
catfile

Rscript $prefix1-VennDiagram.R
exit

ベストアンサー1

これは一行です。

sed 's/^.*\],/ /' yourfile|tr -d '\n'|sed -e '$a\'

この項目をコマンドにオプションとして渡すと、最後の項目を削除してsed使用できます。

sed 's/^.*\],/ /' yourfile|tr -d '\n'

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