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文字のない行に文字を追加する方法

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文字のない行に文字を追加する方法

私のデータの最初の数行は次のとおりです。

scaffold10x_1   AUGUSTUS    gene    3591    3908    0.61    -   .   g1
scaffold10x_1   AUGUSTUS    transcript  3591    3908    0.61    -   .   g1.t1
scaffold10x_1   AUGUSTUS    stop_codon  3591    3593    .   -   0   transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
scaffold10x_1   AUGUSTUS    CDS 3591    3908    0.61    -   0   transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
scaffold10x_1   AUGUSTUS    exon    3591    3908    .   -   .   transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
scaffold10x_1   AUGUSTUS    start_codon 3906    3908    .   -   0   transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";

";最後の列で欠落している行に追加する必要があります。grep -v transcript_id canada.gtf | grep -v "^#"行方不明を識別することに慣れています。これを行うためにLinuxコマンドを使用できますか？

ベストアンサー1

sed方法：

sed 's/[^[:space:]]\+[^;[:space:]]$/"&";/' file

出力：

scaffold10x_1   AUGUSTUS    gene    3591    3908    0.61    -   .   "g1";
scaffold10x_1   AUGUSTUS    transcript  3591    3908    0.61    -   .   "g1.t1";
scaffold10x_1   AUGUSTUS    stop_codon  3591    3593    .   -   0   transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
scaffold10x_1   AUGUSTUS    CDS 3591    3908    0.61    -   0   transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
scaffold10x_1   AUGUSTUS    exon    3591    3908    .   -   .   transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
scaffold10x_1   AUGUSTUS    start_codon 3906    3908    .   -   0   transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";

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