2つのディレクトリを比較して重複ファイルを削除する方法

使用fdupes:

fdupes --delete dir1 dir2

fdupesファイル名またはファイル形式はテストされませんが、ファイルサイズと内容はテストされます（暗黙的にファイル形式を含む）。

例:

$ mkdir dir1 dir2

$ touch dir{1,2}/{a,b,c}

$ tree
.
|-- dir1
|   |-- a
|   |-- b
|   `-- c
`-- dir2
    |-- a
    |-- b
    `-- c

2 directories, 6 files

$ fdupes --delete dir1 dir2
[1] dir1/a
[2] dir1/b
[3] dir1/c
[4] dir2/a
[5] dir2/b
[6] dir2/c

Set 1 of 1, preserve files [1 - 6, all]: 1

   [+] dir1/a
   [-] dir1/b
   [-] dir1/c
   [-] dir2/a
   [-] dir2/b
   [-] dir2/c

$ tree
.
|-- dir1
|   `-- a
`-- dir2

2 directories, 1 file