私はUbuntu 16.04.4を実行しています。テキストファイルから初期条件入力を受け取り、計算を実行して出力ファイルを生成する実行可能ファイルがあります。多くの初期条件に対して計算を実行したかったので、Pythonスクリプト（Spyder 3で実行されているPython 3.5.2）を作成して入力ファイルを生成し、実行ファイルを実行して出力を読みました。
スクリプトは入力テキストファイルをうまく生成するようですが、最初に入力ファイルを開いて変更して保存して閉じないと、実行可能ファイルは入力ファイルを認識しません。たとえば、ファイルを開き、文字を削除し、元の文字に置き換えて保存すると、すべてがうまく機能します。もちろん、これはプロセス自動化の目的に反しています。理由のアイデアがありますか？