両方のファイルを結合したいので、Joinコマンドを使用する必要があります。これは最初のファイルfile1.txtです。
SUBJID SEX DTHHRDY
GTEX-1117F 2 4
GTEX-111CU 1 0
GTEX-111FC 1 1
GTEX-1122O 2 4
2番目のファイルはfile2.txtです。
GTEX-1117F-003-a
GTEX-1117F-003-b
GTEX-111CU-0011-a
GTEX-111FC-0011
GTEX-1122O-0045-a
GTEX-1122O-0045-b
ご覧のとおり、File 1は列1のFile 2と一致しています。また、ファイル 1 の列 2 と列 3 をフィルタリングするには、これら 2 つのフィールドをリンクする必要があります。 2列の場合はすべての値2を取得し、3列の場合はすべての値4を取得する必要があります。
出力が必要
Sample SEX DTHHRDY
GTEX-1117F-003-a 2 4
GTEX-1117F-003-b 2 4
GTEX-1122O-0045-a 2 4
GTEX-1122O-0045-b 2 4
GTEX-1117Fは最初の2行が同じで、違いは-003-aなので、GTEX-1117F-003-aに関連していますが、カットしてみると互いに関連していることがわかります。試しましたが、join -1 1 -1 1 file1.txt file2.txt「接続：互換性のない接続フィールド1、2」というメッセージが表示されました。そしてこれを利用して2つの新しいファイルを生成してawk '{if ($2 == "2") print $1,2,3}'12のデータができましたが、今はfile2.txtでどのようにまとめるのかわかりません。また、joinコマンドを使用する必要があります
ベストアンサー1
head -n 1 file1.txt
join <(paste -d" " <(cut -d- -f1-2 file2.txt) file2.txt | sort) \
<(tail -n +2 file1.txt | sort) \
| cut -d" " -f2- \
| awk '$2 == 2 && $3 == 4' \
| column -t
SUBJID SEX DTHHRDY
GTEX-1117F-003-a 2 4
GTEX-1117F-003-b 2 4
GTEX-1122O-0045-a 2 4
GTEX-1122O-0045-b 2 4