私はこの遺伝子データベースを持っていますが、英数字ではなく追加の値で完全に乱雑です。これは不良データを暗号化したものであり、それをクリーンアップする方法がわかりません。試しましたがsed失敗awkしました。以下は、多数の文書のデータの例です。
chr2#@!!~/\/=\^%$74711&&*&127472363@Pos1%%0^^+
chr3#@!!~/\/=\^%$74723&&*&127473530@Pos2%%0^^+
chr1#@!!~/\/=\^%$73530&&*&127474697@Pos3%%0^^+
chr2#@!!~/\/=\^%$17469&&*&127475864@Pos4%%0^^+
chr3#@!!~/\/=\^%$12747&&*&127477031@Neg1%%0^^-
chr5#@!!~/\/=\^%$17477&&*&127478198@Neg2%%0^^-
chr7#@!!~/\/=\^%$74781&&*&127479365@Neg3%%0^^-
chr7#@!!~/\/=\^%$74795&&*&127480532@Pos5%%0^^+
chr1#@!!~/\/=\^%$12748&&*&127481699@Neg4%%0^^-
整理されたデータは次のようになります。
chr2 74711 127472363 Pos1 0 +
chr3 74723 127473530 Pos2 0 +
chr1 73530 127474697 Pos3 0 +
chr2 17469 127475864 Pos4 0 +
chr3 12747 127477031 Neg1 0 -
chr5 17477 127478198 Neg2 0 -
chr7 74781 127479365 Neg3 0 -
chr7 74795 127480532 Pos5 0 +
chr1 12748 127481699 Neg4 0 -
どうすればいいですか？
ベストアンサー1
これを行うために使用できますsed。起こったことは次のとおりです。
sed 's/[^a-zA-Z0-9+-]/ /g' file | column -tc2
chr2 74711 127472363 Pos1 0 +
chr3 74723 127473530 Pos2 0 +
chr1 73530 127474697 Pos3 0 +
chr2 17469 127475864 Pos4 0 +
chr3 12747 127477031 Neg1 0 -
chr5 17477 127478198 Neg2 0 -
chr7 74781 127479365 Neg3 0 -
chr7 74795 127480532 Pos5 0 +
chr1 12748 127481699 Neg4 0 -