最初の列を除くすべての列の「コロン」を変更したいと思います。
]chr9:67290502]N SUPP_VEC=011 SVLEN=0 SVTYPE=TRA 0 0 0 0/1:NA:58745598:23,0:--:.:TRA:BND00068094:NA:NA:chr10_8544904-chr9_67290502 ./.:NA:58745598:0,4:--:.:TRA:126434_2:NA:NA:chr10_8544903-chr9_67290501
希望の出力
]chr9:67290502]N SUPP_VEC=011 SVLEN=0 SVTYPE=TRA 0 0 0 0/1NA5874559823,0--.TRABND00068094NANAchr10_8544904-chr9_67290502 ./.NA587455980,4--.TRA126434_2NANAchr10_8544903-chr9_67290501
試験を終えた:
sed 's/(chr*.)*.[^: ]//g'
注:最初の4つの列の後には「:」が固定されておらず、どこにでも存在できるため、列を定義する必要はありません。
ベストアンサー1
「列」を考えているなら、awkはコンテンツを解析したいと思います。理想的にはGNU awkにアクセスできます。
この試み:
awk '{for(x=2;x<=NF;x++){gsub(":","",$x)}}1'
テストケース:
$ echo "]chr9:67290502]N SUPP_VEC=011 SVLEN=0 SVTYPE=TRA 0 0 0 0/1:NA:58745598:23,0:--:.:TRA:BND00068094:NA:NA:chr10_8544904-chr9_67290502 ./.:NA:58745598:0,4:--:.:TRA:126434_2:NA:NA:chr10_8544903-chr9_67290501" | awk '{for(x=2;x<=NF;x++){gsub(":","",$x)}}1'
]chr9:67290502]N SUPP_VEC=011 SVLEN=0 SVTYPE=TRA 0 0 0 0/1NA5874559823,0--.TRABND00068094NANAchr10_8544904-chr9_67290502 ./.NA587455980,4--.TRA126434_2NANAchr10_8544903-chr9_67290501