sudoアクセス権を持つユーザーが存在し、jarファイルを別のディレクトリに移動し、そのユーザーとしてjarを実行する前に、ディレクトリとその内容がそのユーザーに属していることを確認してください。
#!/bin/bash
WORKDIR=/app/services/myapp
sudo mv myjar.jar $WORKDIR
sudo chmod -R 755 $WORKDIR
sudo chown -R appuser:appuser $WORKDIR
sudo -S su - appuser -c "java -jar $WORKDIR/myjar.jar"
ただし、次のメッセージが表示されます。
Error: Unable to access jarfile /app/services/myapp/myjar.jar
何が問題なのでしょうか? $WORKDIRをls(sudoを使用)することはできますが、cdに入ることはできません(sudoを使用しても)。