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かっこ内を除くすべて削除

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かっこ内を除くすべて削除

「>」で始まる行からのみ、角かっこを含む角かっこ内にないすべての項目を削除したいと思います。 sedに代わるものはありますか？また、行をアルファベット順に並べ替えたいのです（例： ">"で始まる行とその下の行）。

入力例：

>ID:000:FLKLNFIA_00192 |[Ignicoccus_hospitalis_KIN4-I.gbfspecies]|strain|Ignicoccus_hospitalis_KIN4-I.gbf|LSU ribosomal protei..|447|FLKLNFIA_1(1297538):162644-163090:1 ^^ Archaeagenomesparanahui Ignicoccus_hospitalis_KIN4-I.gbfspecies strain strain.|neighbours:ID:000:FLKLNFIA_00191(1),ID:000:FLKLNFIA_00193(1)|neighbour_genes:LSU ribosomal protei..,SSU ribosomal protei..| 
ATGAGTGTGACTA---TTT---GCAATCAGCTAGCTACTACGTACTGATCGTAGCTGACG
>ID:000:MGCDKLCO_01184 |[Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304.gbfspecies]|strain|Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304.gbf|50S ribosomal protei..|471|MGCDKLCO_1(2178400):1005279-1005749:1 ^^ Archaeagenomesparanahui Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304.gbfspecies strain strain.|neighbours:ID:000:MGCDKLCO_01183(1),ID:000:MGCDKLCO_01185(1)|neighbour_genes:LSU ribosomal protei..,SSU ribosomal protei..|
ATGCGCGCGATAGCTAGCTAGCTAGCTTTAGGGGGATTAGCTA----ACTCTGATTCGGA

予想出力：

>Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304.gbfspecies
ATGCGCGCGATAGCTAGCTAGCTAGCTTTAGGGGGATTAGCTA----ACTCTGATTCGGA
>Ignicoccus_hospitalis_KIN4-I.gbfspecies
ATGAGTGTGACTA---TTT---GCAATCAGCTAGCTACTACGTACTGATCGTAGCTGACG

ありがとう

ベストアンサー1

そしてperl：

perl -ne 'push @l, ">" . join("", /\[(.*?)\]/g) . "\n" . <>;
          END{print for sort @l}' your-file

そしてsed：

<your-file sed 's/^[^[]*\[/>/
                s/\][^[]*\[\{0,1\}//g
                N;s/\n/\[/' |
  sort |
  tr '[' '\n'

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