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数値以外のフィールドを含む行の削除

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数値以外のフィールドを含む行の削除

このようなファイルがありますが、2番目の列に数字以外の文字を含むすべての行を削除したいと思います。

AC 14      68123822        68123928       
AC 16      34977639        34990886        
AG 2       162266065       162266181       
AC RS00192.1      415332  415454  
AD RS00228.1      20113   20230   
AC ST00228.1      22673   22791   
AC ME103_ID    190936293       190936410       
AD ME103_ID    190938851       190938969       
AH ME145_ID    147089817       147089932

削除された行数を計算する方法はありますか？ありがとうございます！

ベストアンサー1

$ awk 'BEGIN {count=0};
       NF>1 && $2 ~ /^[[:digit:]]+$/ {print;next};
       {count++};
       END { print "Removed " count " lines." }' input.txt 
AC 14      68123822        68123928
AC 16      34977639        34990886
AG 2       162266065       162266181
Removed 6 lines.

小数点が問題ない場合は、代わりに以下を使用してください。

$ awk 'BEGIN {count=0};
       NF>1 && $2 ~ /^[[:digit:]]+(\.[[:digit:]]+)?$/ {print;next};
       {count++};
       END { print "Removed " count " lines." }' input.txt

このバージョンの出力は、小数点を持つ純粋な数字の2番目のフィールドがないという点で、入力例と同じです。

ただし、デフォルトの出力から削除された行数が必要ない場合は、デフォルトのstdoutの代わりにstderrとして印刷できます。 ENDブロックを次に置き換えます。

END { print "Removed " count " lines." > "/dev/stderr" }

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