TSVファイルがあります。列5の特定の値に対してすべての行を抽出し、3つの列を切り捨てて、一意の行数を計算しようとしています。たとえば、列 5 の文字列 "abc" の場合は、次のようにします。
awk '$5 == "abc"' file.tsv | cut -f 1-3 | sort -u | wc -l
しかし、「abc」だけでなく、列5のすべての一意の文字列に対してこれを行いたいと思います。 「for i in $5」のようなものが必要ですが、私はこの「forループ」をよく理解していません。文字列が多すぎるため、個々のコマンドを発行できません。
ベストアンサー1
これにより、期待される結果が印刷されます。
cut -f 1-3,5 file.tsv | sort -u | cut -f 4 | sort | uniq -c | awk '{ print $2, $1; }'
説明する：
cut -f 1-3,5 file.tsv関連列1、2、3、5抽出
sort -u固有の組み合わせの取得
cut -f 4現在の列4の元の5番目の列値のみ抽出固有値のソート
sort | uniq -cと計算列の
awk '{ print $2 "\t" $1; }'交換と出力の書式設定