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あるファイルの一致する文字列を別のファイルの一致する文字列に置き換えるには？

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あるファイルの一致する文字列を別のファイルの一致する文字列に置き換えるには？

次のファイルがあります。

head cleandata.map
1   1:775852:T:C    0   775852
1   1:1120590:A:C   0   1120590
1   1:1145994:T:C   0   1145994
1   1:1148494:A:G   0   1148494
...

別のファイルがあります：

head lifted.map
1   1:775852:T:C    0.0 785989
1   1:1120590:A:C   0.0 1130727
1   1:1145994:T:C   0.0 1156131
1   1:1148494:A:G   0.0 1158631
...

私が得たいのは、cleandata.mapを次のように変更することです。

1   1:785989:T:C    0   785989
1   1:1130727:A:C   0   1130727
1   1:1156131:T:C   0   1156131
1   1:1158631:A:G   0   1158631
...

したがって、リフト.mapの列2の行がcleandata.mapの列2の行と一致する場合は、cleandata.mapの列2と4の行をリフト.mapの列4の値に置き換えます。

ベストアンサー1

努力する

$ awk 'FNR==NR {T[$2] = $4; next} $2 in T {gsub ($4, T[$2])} 1' file2 file1
1   1:785989:T:C    0   785989
1   1:1130727:A:C   0   1130727
1   1:1156131:T:C   0   1156131
1   1:1158631:A:G   0   1158631

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