次のファイルがあります。
head 1kG_MDS6.bim
1 rs2073813 0 753541 A G
1 rs60320384 0 769223 G C
1 rs59066358 0 771967 A G
...
「：」で区切られた最初、4番目、6番目、5番目の列を順番に連結したいと思います。
したがって、出力は次のようになります。
1:753541:G:A
1:769223:C:G
1:771967:G:A
私はこれを試しました：
awk ' { print $1 $4 $6 $5 ":" $NF } ' 1kG_MDS6.bim > 1kG_MDS6_SNPs1.txt
しかし、最後の2つの列":"とのみ結合されます。
ベストアンサー1
出力フィールド区切り文字を使用します。
awk 'BEGIN{OFS=":"} {print $1,$4,$6,$5}' file
出力：
1:753541:G:A 1:769223:C:G 1:771967:G:A