次のファイルがあります。
$ cat file
rep1 rep2
g1001_INpfu_DN44908_c3_g1 17.85 19.95
g10042/1330/2846_INpfu_DN43979_c0_g3 34.07 29.19
g1077/1457/278/278_INpfu_PRJNA287145_DN42983_c0_g1 20.69 21.64
g100/100_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g79/79/79/79_INpfu_DN45068_c4_g1 58.83 74.58
最初の「_」の前のテキストはグループ番号です。例えば
- G 数字 _ ...
- G 番号1 / 2回 _ ...
- G 番号1 / 2回 / 3回 _ ...
（説明の便宜のためにスペースを入れました。）スラッシュは複数のグループを意味します。たまに重複したグループ番号が連続していて削除したい場合があります。
予想される結果は次のとおりです。
rep1 rep2
g1001_INpfu_DN44908_c3_g1 17.85 19.95
g10042/1330/2846_INpfu_DN43979_c0_g3 34.07 29.19
g1077/1457/278_INpfu_PRJNA287145_DN42983_c0_g1 20.69 21.64
g100_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g79_INpfu_DN45068_c4_g1 58.83 74.58
最後の3行では、同じグループ番号が削除され、一意のグループ番号だけが残ります。
ベストアンサー1
以下を使用して、このようなことを試すことができますsed。
$ sed -e :a -e 's:\([0-9][0-9]*\)/\1:\1:' -e ta file
rep1 rep2
g1001_INpfu_DN44908_c3_g1 17.85 19.95
g10042/1330/2846_INpfu_DN43979_c0_g3 34.07 29.19
g1077/1457/278_INpfu_PRJNA287145_DN42983_c0_g1 20.69 21.64
g100_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g79_INpfu_DN45068_c4_g1 58.83 74.58
部分一致を処理するには（たとえば、andに変換しないg512/12/x）、両側に数字以外のアンカーを追加できます。g512/5120/xg512/xg5120/x
sed -e :a -e 's:\([^0-9]\)\([0-9][0-9]*\)/\2\([^0-9]\):\1\2\3:' -e ta file
または、より読みやすく拡張正規表現を使用してください。
sed -E -e :a -e 's:([^0-9])([0-9]+)/\2([^0-9]):\1\2\3:' -e ta file
前任者。与えられた
$ cat file
rep1 rep2
g1001_INpfu_DN44908_c3_g1 17.85 19.95
g10042/1330/2846_INpfu_DN43979_c0_g3 34.07 29.19
g1077/1457/278/278_INpfu_PRJNA287145_DN42983_c0_g1 20.69 21.64
g512/12_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g100/100_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g512/5120_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g79/79/79/79_INpfu_DN45068_c4_g1 58.83 74.58
それから
$ sed -E -e :a -e 's:([^0-9])([0-9]+)/\2([^0-9]):\1\2\3:' -e ta file
rep1 rep2
g1001_INpfu_DN44908_c3_g1 17.85 19.95
g10042/1330/2846_INpfu_DN43979_c0_g3 34.07 29.19
g1077/1457/278_INpfu_PRJNA287145_DN42983_c0_g1 20.69 21.64
g512/12_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g100_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g512/5120_INpfu_DN43143_c0_g1 52.36 33.64
g79_INpfu_DN45068_c4_g1 58.83 74.58