暗号化されたことを証明できないようにハードドライブを暗号化する方法はありますか？

合理的な拒否を意味すると仮定すると、そうです。

vera-cryptとdmcrypt（cryptsetup）には、暗号化されたボリュームのメタデータがディスクに書き込まれないモードがあり、いかなる種類のヘッダもありません。最終結果は、ディスクに書き込まれたランダムなデータのように見えます。

詳細については、vera-cryptのドキュメントを参照してください。合理的な否認性そしてdmcrypts FAQDM - 通常（質問2.4まで下にスクロールしてください）。