2つのリスト間の厳しいgrep

2つの異なるtxtファイルがあります。 「all_E3.txt」という最初の項目にはオブジェクトのリスト（列）が含まれ、そのリストには重複したオブジェクトもたくさんあります。 「UPS.txt」という別のファイルには、列にオブジェクトのリストがあり（重複なし）、各オブジェクトは変数（同じ行とは異なる列、数字、または「NA」）に関連付けられています。

このファイルには、「all_E3.txt」ファイルにもオブジェクトがあります（ただしこれに限定されません）。 「ALL_E3.txt」にあるすべてのオブジェクトと、「UPS.txt」に応じた対応する変数を含む「output_UPS.txt」という別のファイルをインポートしたいと思います。たとえば、

• ファイル "all_E3.txt":

  AMFR
  AMFR
  AMFR
  ANAPC11
  CRB
  CRB
  TER
  CAM
  DVDE
  

• ファイル2「UPS.txt」

  AMFR 0
  REF 1
  SDRF N.A.
  BHU 3 
  ANAPC11 2
  CRB 2
  YUT 1
  TER 0
  CAM 3
  WERS N.A.
  DVDE 3
  

• ファイル出力 "output_UPS.txt"

  AMFR 0
  AMFR 0
  AMFR 0
  ANAPC11 2
  CRB 2
  CRB 2
  TER 0
  CAM 3
  DVDE 3
  

他の組織のファイルを使用する同様の設定で、友達のアドバイスに従って次のことを試しました。

for name in ????_?
do
   for file in $name/Pocket_???_$name\.pdb_OUTPUT.txt
   do
      grep -H Exposed $file | uniq
   done
done 

しかし、現在の状況に適応することはできません。オペレーティングシステムはCentOS 7です。

誰でも私を助けることができますか？ありがとうございます。