指定したディレクトリにファイルをコピーする

Question

#!/bin/bash

shopt -s nullglob

cd home/Desktop/chain/file || exit 1

for name in ./*.pdb*; do
    for dir in "../${name%.pdb*}"*/; do
        cp "$name" "$dir"
    done
done

その後、ディレクトリ内のすべてのPDBファイルを繰り返し、home/Desktop/chain/file 各$name繰り返しごとに名前を保存します。.pdb名前の末尾に文字が1つしかないと判断した場合は、パターンを./*.pdb*に変更./*.pdb?し、内部ループのパラメータ置換に使用されるパターンをそれに応じて変更する必要があります。

.pdb*各ファイルに対して、ファイルは削除されたサフィックスのある名前home/Desktop/chain（${name%.pdb*}つまり、削除されたサフィックスが一致するファイル名.pdb*）に対応する対応するディレクトリの各ディレクトリにコピーされます。これは内部ループで行われます。

内部ループは必要cpなぜなら、あなたがやろうとしているように、複数のターゲットディレクトリで作業することは不可能だからです。

起動時にシェルオプションを設定すると、nullglobモードは次のように保証されます。削除済み一致するものが存在しないときに拡張しないままにする代わりに。

はい（ディレクトリビューを表示chain）

$ tree -F
.
|-- 1b47_A/
|-- 1b47_B/
|-- 3rty_H/
|-- 7yt5_2/
|-- 7yt5_5/
|-- 7yt5_L/
`-- file/
    |-- 1b47.pdb1
    |-- 3rty.pdb1
    |-- 3rty.pdb3
    |-- 7yt5.pdb1
    |-- 7yt5.pdb2
    `-- 7yt5.pdb5

7 directories, 6 files

ループはここで実行されます。結果：

$ tree -F
.
|-- 1b47_A/
|   `-- 1b47.pdb1
|-- 1b47_B/
|   `-- 1b47.pdb1
|-- 3rty_H/
|   |-- 3rty.pdb1
|   `-- 3rty.pdb3
|-- 7yt5_2/
|   |-- 7yt5.pdb1
|   |-- 7yt5.pdb2
|   `-- 7yt5.pdb5
|-- 7yt5_5/
|   |-- 7yt5.pdb1
|   |-- 7yt5.pdb2
|   `-- 7yt5.pdb5
|-- 7yt5_L/
|   |-- 7yt5.pdb1
|   |-- 7yt5.pdb2
|   `-- 7yt5.pdb5
`-- file/
    |-- 1b47.pdb1
    |-- 3rty.pdb1
    |-- 3rty.pdb3
    |-- 7yt5.pdb1
    |-- 7yt5.pdb2
    `-- 7yt5.pdb5

7 directories, 19 files

スペースを節約できます。コピーこれらのファイルはハードリンクを生成します。単にスクリプトからに変更するだけcpです。ln

することができますいいえ別のディレクトリー内の同じ名前のファイルとは別に、ディレクトリー内のファイルを変更する場合は、これを実行してください。ハードリンクはファイルの追加名にすぎません。

Answer 1

#!/bin/bash

shopt -s nullglob

cd home/Desktop/chain/file || exit 1

for name in ./*.pdb*; do
    for dir in "../${name%.pdb*}"*/; do
        cp "$name" "$dir"
    done
done