特定の文字列の後の数字がしきい値より大きい行を解析する方法は？

Question

これはJSONと似ているため、コマンドラインJSONパーサーを使用してください。

$ jq '.[] | select((.r2|tonumber) > 0.7 and (.r2|tonumber) <= 1)' file
{
  "variation1": "rs6139746",
  "r2": "0.910749",
  "d_prime": "0.638509",
  "population_name": "1000GENOMES:phase_3:KHV",
  "variation2": "rs6072937"
}

r2キー値を文字列から正しい数値に変換するために使用する必要がありますtonumberが、それ以外は単純なフィルタですselect()。

わずかに短縮したり、少なくとも各数値を変換することを避けることができます。二重と

jq '.[] | (.r2|tonumber) as $r2 | select($r2 > 0.7 and $r2 <= 1)' file

結果が入力と同じ形式である場合は、次のようにします。

$ jq -c '.[] | (.r2|tonumber) as $r2 | select($r2 > 0.7 and $r2 <= 1) | [.]' file
[{"variation1":"rs6139746","r2":"0.910749","d_prime":"0.638509","population_name":"1000GENOMES:phase_3:KHV","variation2":"rs6072937"}]

つまり、「コンパクトな出力」を要求し、フィルタを介して抽出され-cた各結果の配列を生成するために使用します。select()[.]

Answer 1

これはJSONと似ているため、コマンドラインJSONパーサーを使用してください。

$ jq '.[] | select((.r2|tonumber) > 0.7 and (.r2|tonumber) <= 1)' file
{
  "variation1": "rs6139746",
  "r2": "0.910749",
  "d_prime": "0.638509",
  "population_name": "1000GENOMES:phase_3:KHV",
  "variation2": "rs6072937"
}

r2キー値を文字列から正しい数値に変換するために使用する必要がありますtonumberが、それ以外は単純なフィルタですselect()。

わずかに短縮したり、少なくとも各数値を変換することを避けることができます。二重と

jq '.[] | (.r2|tonumber) as $r2 | select($r2 > 0.7 and $r2 <= 1)' file

結果が入力と同じ形式である場合は、次のようにします。

$ jq -c '.[] | (.r2|tonumber) as $r2 | select($r2 > 0.7 and $r2 <= 1) | [.]' file
[{"variation1":"rs6139746","r2":"0.910749","d_prime":"0.638509","population_name":"1000GENOMES:phase_3:KHV","variation2":"rs6072937"}]

つまり、「コンパクトな出力」を要求し、フィルタを介して抽出され-cた各結果の配列を生成するために使用します。select()[.]

特定の文字列の後の数字がしきい値より大きい行を解析する方法は？

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