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列の各記号（+/-）の値を置き換えます。

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列の各記号（+/-）の値を置き換えます。

ゲノム座標を使用して.bedファイルを作成しようとしていますが、ほぼ同じです。最後のステップだけが残りました。次のファイルがあります。

LQNS02278165.1  13104710        13109495        BEL-1_PH-I      4785
LQNS02278165.1  9139127         9142308         BEL-1_PH-I      3181
LQNS02278165.1  9222957         9221339         BEL-1_PH-I      -1618

5列をゲノムの方向になる記号に置き換える必要があります。理想的には、出力は次のようになります。

LQNS02278165.1  13104710        13109495        BEL-1_PH-I      +
LQNS02278165.1  9139127         9142308         BEL-1_PH-I      +
LQNS02278165.1  9222957         9221339         BEL-1_PH-I      -

awkのアドバイスをいただきありがとうございます！ありがとう

ベストアンサー1

これで十分です。

awk '{$NF=($NF<0 ? "-" : "+")}1' file

  • $NF=($NF<0 ? "-" : "+")最後のフィールドが負の場合はマイナス記号に置き換え、それ以外の場合はプラス記号に置き換えます。

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