以下の形式のファイルがあります。
ATOM 126 CD GLN A 449 -2.853 11.592 119.709 1.00 17.95 C
ATOM 127 OE1 GLN A 449 -4.056 11.297 119.695 1.00 20.83 O
ATOM 128 NE2 GLN A 449 -1.948 10.876 120.359 1.00 14.98 N
HETATM 129 N MSE A 450 -4.523 16.830 119.280 1.00 14.88 N
HETATM 130 CA MSE A 450 -5.537 17.804 118.911 1.00 15.65 C
ファイルには、最初の列に異なる名前を持つ数百の行があります。 ATOMという行(最初の列)とATOMの11番目の列の値を抽出したいと思います。次に、値を並べ替えます(最も小さいものから最大のものまで)。 grep、awk、sedなどを使用してこれを行い、.txtファイルに出力するにはどうすればよいですか?
ベストアンサー1
awk '$1=="ATOM"{print $11}' file | sort -n > foo.txt
または:
awk '$1=="ATOM"{print $1, $11}' file | sort -k2,2n > foo.txt
ATOMを出力に含めるかどうかによって異なります。