コマンドラインツールを使用してログインが必要なLinux VMからファイルをダウンロードする

APIトークンを使用して、プログラムでUMLSファイルをダウンロードできます。プロセスは次のとおりです。https://documentation.uts.nlm.nih.gov/automating-downloads.html

• ステップ1：UMLS設定ファイルからAPIキーをインポートします。ログインすると、UTS「マイプロファイル」領域でAPIキーを見つけることができます。
• ステップ2：次のスクリプトを使用して必要なファイルをダウンロードします。

#!/bin/bash

export apikey=$1
export DOWNLOAD_URL=$2

export CAS_LOGIN_URL=https://utslogin.nlm.nih.gov/cas/v1/api-key


if [ $# -eq 0 ]; then echo "Usage: download.sh apikey download_url"
                      echo "  e.g. download.sh e33c59db-1234-abcd-efgh-0117ab2cd5gh2  https://download.nlm.nih.gov/umls/kss/rxnorm/RxNorm_full_current.zip"
                      echo "       download.sh e33c59db-1234-abcd-efgh-0117ab2cd5gh2 https://download.nlm.nih.gov/umls/kss/rxnorm/RxNorm_weekly_current.zip"
   exit
fi


if [ -z "$apikey" ]; then echo " Please enter you api key "
   exit
fi

if [ -z "$DOWNLOAD_URL" ]; then echo " Please enter the download_url "
   exit
fi


TGT=$(curl -d "apikey="$apikey -H "Content-Type: application/x-www-form-urlencoded" -X POST https://utslogin.nlm.nih.gov/cas/v1/api-key)

TGTTICKET=$(echo $TGT | tr "=" "\n")

for TICKET in $TGTTICKET
do
    if [[ "$TICKET" == *"TGT"* ]]; then
      SUBSTRING=$(echo $TICKET| cut -d'/' -f 7)
      TGTVALUE=$(echo $SUBSTRING | sed 's/.$//')
    fi
done
echo $TGTVALUE
STTICKET=$(curl -d "service="$DOWNLOAD_URL -H "Content-Type: application/x-www-form-urlencoded" -X POST https://utslogin.nlm.nih.gov/cas/v1/tickets/$TGTVALUE)
echo $STTICKET

curl -c cookie.txt -b cookie.txt -L -O -J $DOWNLOAD_URL?ticket=$STTICKET
rm cookie.txt

download.sh上記のスクリプトを次のように呼び出すことができるファイルに保存します。

$ bash download.sh e33c59db-1234-abcd-efgh-0117ab2cd5gh2  https://download.nlm.nih.gov/umls/kss/2020AB/umls-2020AB-full.zip