Unixの「fsck」はWindowsの「chkdsk」とどう違うのですか？

ファイルシステムの内部構造はまったく異なるため、ファイルシステムごとに異なるプログラムが必要です。 UNIX / Linuxシステムでも、各ファイルシステムの実装（ext *、xfs、jfsなど）には専用のファイルシステムチェッカーがあります。

通常、初期コマンドchkdsk / fsckは基本ファイルシステムの形式を確認してから専用チェッカーを呼び出します。