私はUnixに最初に触れ、Rで使用していたスクリプトを変換したいと思います。これには、ファイル名のバリエーションが異なる3つのファイル（同じ長さ）があります。各ファイルから1行を取り、3つのファイルすべてを1行ずつ繰り返したいと思います。しかし、複数の変数をforループに組み込む方法がわかりません。
module load bbtools
for i in fna and j in fna2 and k in fna.prefix;
do
rename.sh -Xmx20g in=",${i}," out=",${j}" prefix=",${k}"
done
Rスクリプトを呼び出さずに直接実行する方法はありますか？
ベストアンサー1
このコマンドを使用できますpaste。ファイルの場合：
a.txt
1
2
3
b.txt
a
b
c
c.txt
z
x
y
コマンド出力の例は次のとおりです。
$ paste -d, a.txt b.txt c.txt
1,x,a
2,y,b
3,z,c
その後、パイプすることができます（正しい区切り記号、つまりコマンドで使用された区切り文字を使用paste）。
paste -d, a.txt b.txt c.txt | while IFS=',' read -r f1 f2 f3; do
# do your task with $f1 $f2 $3
done