☰

複数のファイルを読み取るためのBashスクリプト

tag-icon • tag-icon shell-script parallelism r qsub
複数のファイルを読み取るためのBashスクリプト

読み取る必要があるRスクリプトが複数あります（最大3つ、tr1.R、tr2.R、tr3.R）。
以下は、単一のスクリプトを読み取るbashスクリプトです。

#!/bin/bash
#PBS -l nodes=1:ppn=10,walltime=00:05:00
#PBS -M 
#PBS -m e
module load R/4.0
Rscript ~/tr1.R

提案されたとおり、以下を試しました。@カス

#!/bin/bash
#PBS -l nodes=1:ppn=10,walltime=00:05:00
#PBS -M 
#PBS -m e
module load R/4.0
**Rscript ~/tr"$i".R**

また、課題は以下を使用して送信されます。

for i in {1..3} ; do
  qsub -o "default.$i.out" -e "errorfile$i" -v i script.sh
done

読めません。Rscript ~/tr"$i".R。

ベストアンサー1

これは速くて厄介です。

#!/bin/bash

echo -e "Printing script.......\n"

y=0
for (( y=0; y <= 9; y++ ))
do
   echo "file tr$y.R contents: "
   cat tr$y.R
   echo ""   
done

おすすめ記事