N
ファイルの2番目の列の文字数を数え、この数を3番目の列に印刷したいと思います。入力ファイルの例(タブ区切り):
sample1 TCTNG
sample2 CCNGGGGGTN
sample3 GGGNNNTC
希望の出力(タブ区切り):
sample1 TCTNG 1
sample2 CCNGGGGGTN 2
sample3 GGGNNNTC 3
次の混乱したバージョンを入手できますが、可能であれば1行のバージョンが必要ですawk
。
> awk -F '\t' '{print $2}' file.txt | awk -FN '{print NF-1}' > NCount.txt
> paste -d '\t' file.txt NCount.txt
sample1 TCTNG
1
sample2 CCNGGGGGTN
2
sample3 GGGNNNTC
3
ベストアンサー1
awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} {print $0, gsub(/N/,"",$2)}' file
sample1 TCTNG 1
sample2 CCNGGGGGTN 2
sample3 GGGNNNTC 3
ベース: 1行あたりのパターン数を印刷するには?