Pythonが3つの異なる場所にあるのはなぜですか？どちらを維持する必要があり、残りはどのように削除しますか？

実際には2つの異なる場所です。これは/binシンボリックリンクであり、同じファイルです。これを絶対に削除してはいけません。これはPythonのシステムバージョンであり、これを削除するとシステムが破損する可能性があります（多くの重要なツールとアプリケーションがPythonで書かれており、それを使用しています）。/usr/bin/bin/python3/usr/bin/python3

これは/usr/local/bin/python3別の（最新の）バージョンである手動でインストールした可能性があります。/usr/localインストールの目的は次のとおりです。ローカルインストールソフトウェア。これを削除するには、それをインストールしたのと同じツール/チュートリアル/手順を使用して削除する必要があります。

注：Pythonで開発する場合は、次のものを使用する必要があります。仮想環境Pythonシステムがハングするのを防ぐために。