一部のデータに対してFASTQCを実行しようとしています。私はrootアクセス権のないサーバーで作業しています。サーバーへのrootアクセス権がなく、ファイルを解凍できないため、私のホームスペースにfastqcをインストールする方法を知っている人はいますか？
ベストアンサー1
使用condaインストールするfastqc。私はconda別のツールに別の環境を使用することを好むが、YMMVです。biocondaチャンネルに含まれていない場合は、恒久的に追加するか、次のコマンドを使用して追加してください-c bioconda。
例:
# Install the most recent version of fastqc in environment
# called also "fastqc" (or use a different name):
conda create -n fastqc fastqc
# Install a specific version of fastqc into its own environment:
conda create -n fastqc-0.11.9 fastqc=0.11.9