SFTPクライアントで2段階認証を使用できますか？

ファイルを転送したりWebサーバーにコードをアップロードしたりするために、2段階認証プロセスを統合できますか？

もちろんです。 SFTPの認証層はSSHを介して実行されるため、SSHと連携するすべての方法（例：https://developer.ibm.com/blogs/two-factor-authentication-for-ssh/（他にもたくさんあります。本質的に、sshdは完全な認証者セットが必要だと言うことができます。）

それでは、すべてのクライアントに適用されますか、それとも特定のSFTPクライアントに適用されますか？

あなたの顧客は、あなたが持っているすべての要素を埋め込んだり接続したりできるようにする必要があります。ただし、前述したように、これは基本的なSSH機能を介してのみ発生します。

ただし、SSHキーは通常スマートカードに安全に保存され、ロックが解除されるまで使用できません。これはそれ自体の2つの要素（ハードウェアトークン「スマートカード」、PINによるロック解除）であり、よくサポートされています。