HDD は hdparm -S フラグを認識しません。

Advanced Power Management Featureに設定してみてください127。

hdparmマンページ：

-B     Get/set  Advanced  Power  Management feature, if the drive supports it. A low value
       means aggressive power management  and  a  high  value  means  better  performance.
       Possible  settings  range  from  values 1 through 127 (which permit spin-down), and
       values 128 through 254 (which do not permit  spin-down).   The  highest  degree  of
       power  management  is attained with a setting of 1, and the highest I/O performance
       with a setting of 254.  A value of 255  tells  hdparm  to  disable  Advanced  Power
       Management  altogether  on the drive (not all drives support disabling it, but most
       do).

高度な電源管理機能を128未満の値に設定して、ドライブの回転速度を遅くすることができます。希望のアイドル時間を設定するためのタイムアウト-S parameter。ただし、たとえば、高度な電源管理機能がオフの場合、ファームウェアはこのパラメータに従わない可能性があります。