PyMOLはすでに私のLinuxコンピュータにインストールされています。pymol -cp pymol_api_test.py
スクリプトの作成時に実行されるため、インストールされていることがわかります。
pymol
ただし、スクリプトを実行するためにコマンドを使用したくありません。python3
コマンドを使用してスクリプトを実行したいです。
以下は私のスクリプトです。
import pymol
from pymol import cmd
print(cmd.align("/home/bbq_spatial/bbq_input_pdb/pdb1a6j.pdb",
"/home/bbq_spatial/bbq_output_pdb/pdb1a6j.pdb",
cycles=0, transform=0))
次のように呼び出すと実行されませんpython3
。
user_name@server_name:~$ nano pymol_api_test.py
user_name@server_name:~$ python3 pymol_api_test.py
Traceback (most recent call last):
File "pymol_api_test.py", line 1, in <module>
import pymol
ModuleNotFoundError: No module named 'pymol'
user_name@server_name:~$
この問題をどのように解決できますか?