という関数を使用する必要があります。クラスコ、誰の子なのかBitBucketでホストされています。
このアプリケーションは、次のライブラリを使用します。チクラップ、誰の子なのかGitHubでホストされています。
フォローしてみました。インストールに関する注意TCLAPによって提供されましたが失敗しました。
このパッケージをコンパイルする最も簡単な方法は次のとおりです。
cdパッケージソースコードを含むディレクトリに移動し、./configureシステムに合わせてパッケージ構成を入力します。以前のバージョンのSystem Vを使用している場合は、直接入力しようとしないようにcsh入力する必要があります。sh ./configurecshconfigure走るには
configure時間がかかります。実行時にチェックしている機能を知らせるメッセージがいくつか表示されます。
私は何をすべきかわかりません。
誰でも助けることができますか？
編集する：
REMOで使用できるように、seq.datファイルとseq.txtファイルを直接作成しようとしています。私はmkseq.plスクリプトを使用しています。
私のコマンドは次のとおりです。
user_name@server_name:~/spatial/reconstruction_tools/remo_v2$ perl
mkseq.pl /home/spatial/input_pdb/pdb1a6j.pdb 1
PSIPRED finished
user_name@server_name:~/spatial/reconstruction_tools/remo_v2$
このコマンドは4つのファイルを生成しました。
- シーケンスデータ
- 高速タンパク質
- psimp27331007f0101.blast
- psimp27331007f0101.fasta
seq.datが完全に空です。 psimp27331007f0101.blastも実際には空です。 seq.txt は表示されません。