"/var/lib/platpak/exports/share" は、XDG_DATA_HOME および XDG_DATA_DIRS によって設定された検索パスにありません。

奇妙なことに、Flatpaksを更新すると、端末に次のメッセージが表示されます。

Note that '/var/lib/flatpak/exports/share' is not in the search path
set by the XDG_DATA_HOME and XDG_DATA_DIRS
environment variables, so applications may not
be able to find it until you set them. The
directories currently searched are:

- /root/.local/share

ただし、実行すると、 echo $XDG_DATA_DIRS 次のような結果が表示されます。

/home/myname/.local/share/flatpak/exports/share:/var/lib/flatpak/exports/share:/usr/local/share/:/usr/share/

Linuxに初めて触れましたが、何か抜けましたか？

状況に応じてFedora 37を使用しています。