ディープラーニング中に大量のファイルを移動すると、Ubuntuが遅くなります。

Ubuntu 22.04を使用しています。大容量データセット（200 GB以上）をSSDからHDDに移動すると、約1時間後にコンピュータが遅くなりました。同時にディープラーニングプログラムを実行しています（同じ時間後に停止します）。

CPU、RAM、IOを確認しましたが、問題ありません。

一部のコマンドはすばやく実行されますが（lsなど）、他のコマンドはそうではありません（aptなど）。そして再起動の速度も非常に遅くなります。