大きなテキストファイルがありますが、7列(BETA)から8列(SE)までの値を分割し、結果(11列)を含むテーブルの末尾に新しい列を作成したいと思います。問題は、7列の値の一部が0を超えて負数であることです。
SNP CHR BP A1 AX A1_FREQ BETA SE P OBS_CT
rs10875231 1 100000012 T G 0.405 -0.0456807 0.02260471 0.04335677 4400
rs6678176 1 100000827 C T 0.383 0.02553138 0.02287662 0.2645817 4400
rs78590530 1 100000948 A G 0.016 0.171376 0.08757958 0.05035017 4400
rs149636485 1 100001060 A G 0.004 -0.03363731 0.1819208 0.8529224 4400
rs116216467 1 100001233 C T 0.043 -0.06690947 0.05683414 0.238941 4400
ベストアンサー1
数字以外の文字列を含む最初の行が原因でエラーが発生します。次のように除外できます。
NR!=1 { $11 = $7/$8 }
1
これで、列8にゼロがある可能性があると思われる場合は、$ 8がゼロでないことを確認する必要があります。パターンに条件を追加できます。
NR!=1 && $8!=0 { $11 = $7/$8 }
1
または、if
以下を追加してください。
{ if (NR!=1 && $8!=0) $11 = $7/$8; print }
負の値がなぜ問題なのかわかりません。