私はIPythonノートブックBiopythonで作成したゲノムチャートをインタラクティブに分析する方法としてGenomeDiagram
モジュール。IPython ノートブックでインライン グラフを取得する方法については詳細なドキュメントがありますがmatplotlib
、GenomeDiagram は ReportLab ツールキットを使用しますが、これは IPython でのインライン グラフ作成にはサポートされていないと思います。
しかし、この問題を回避する方法として、プロット/ゲノム図をファイルに書き出してから、画像をインラインで開くと、次のような同じ結果が得られると考えていました。
gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")
しかし、どうすればいいのか、あるいはそれが可能かどうかもわかりません。IPython で画像を開いたり表示したりできるかどうか知っている人はいませんか?
ベストアンサー1
提供元この郵便受け、次の操作を実行できます。
from IPython.display import Image
Image(filename='test.png')