論理条件に基づいて行をフィルタリングしたいdata.frame
。次のようなデータフレームがあるとします。
expr_value cell_type
1 5.345618 bj fibroblast
2 5.195871 bj fibroblast
3 5.247274 bj fibroblast
4 5.929771 hesc
5 5.873096 hesc
6 5.665857 hesc
7 6.791656 hips
8 7.133673 hips
9 7.574058 hips
10 7.208041 hips
11 7.402100 hips
12 7.167792 hips
13 7.156971 hips
14 7.197543 hips
15 7.035404 hips
16 7.269474 hips
17 6.715059 hips
18 7.434339 hips
19 6.997586 hips
20 7.619770 hips
21 7.490749 hips
私がしたいのは、見た目は同じだが、1 つの cell_type のデータのみを持つ新しいデータ フレームを取得することです。たとえば、セル タイプ "hesc" を含む行をサブセット化/選択します。
expr_value cell_type
1 5.929771 hesc
2 5.873096 hesc
3 5.665857 hesc
または、細胞タイプ「bj 線維芽細胞」または「hesc」のいずれか:
expr_value cell_type
1 5.345618 bj fibroblast
2 5.195871 bj fibroblast
3 5.247274 bj fibroblast
4 5.929771 hesc
5 5.873096 hesc
6 5.665857 hesc
これを簡単に行う方法はありますか?
私はもう試した:
expr[expr[2] == 'hesc']
# [1] "5.929771" "5.873096" "5.665857" "hesc" "hesc" "hesc"
元のデータフレームが「expr」と呼ばれている場合、結果は間違った形式で返されます。
ベストアンサー1
行を選択するには1つ'cell_type' (例 'hesc') の場合は、以下を使用します==
:
expr[expr$cell_type == "hesc", ]
2つ以上の異なる「cell_type」に従って行を選択するには(例: 'hesc'または'bj 線維芽細胞')の場合は、次を使用します%in%
。
expr[expr$cell_type %in% c("hesc", "bj fibroblast"), ]