各（データ）行が一意である必要がある大量のデータがあります。
フォルダに多くのファイルがあることはすでに事実です。サイズは約15GBで、約170個のファイルに分かれており、合計1,000,000本のラインがあります。このフォルダをと呼びますfoo。
2番目のフォルダ（bar）にはより多くのデータが含まれます。つまり、ファイルごとに1つのエントリのみが含まれます。両方のファイルの交差部分がbar必ず空である必要はありません。各ファイルには約15,000行があります（そしてその中には何千ものファイルがありますbar）。
今私は使っています。
awk 'NR==FNR{a[$0]=$0;next}!a[$0]' foo/file bar/file > tmp
mv tmp bar/file
すべてのファイルを繰り返しfooてbar。foo空の場合はループを解除しますbar/file。ロック（複数のノードで）と並列実行（各ノードで）を使用して並列化しました。しかし、まだ時間がかかります。
パフォーマンス向上の可能性は何ですか？のファイルの理想的なファイルサイズは何ですかfoo？もちろん、これはマシン（RAM/CPU/ストレージ）によって異なりますが、ここで良い経験則は何ですか？
長すぎます。：合計に複数回表示されるデータ行をfoo含む、一意のデータ行を含めます。bar重複したアイテムを削除してマージできます。barfoobarfoo
【書き直す】空行なし[/直す]
ベストアンサー1
あなたの質問を理解したかどうかはわかりませんが、コードは次のように最適化される可能性があります。
awk '!x{a[$0];next}; !($0 in a)' foo/file x=1 bar/file > tmp
（空行や「0」と解釈される行に問題があるようです。）
ファイルがソートされたら、次のことができます。
comm -13 foo/file bar/file > tmp
そうでない場合（ksh93.zshまたはbash構文）：
comm -13 <(sort foo/file) <(sort bar/file) > tmp
（awkソリューションより必ずしも高速ではありません）
また、特にGNU awkの場合、ロケールをC / POSIXに設定すると、より良いパフォーマンスが得られます。
LC_ALL=C awk ...