ファイル名一致パターン

ファイル名一致パターン

処理する必要がある200個の衛星ファイルを含むフォルダがあります。プロセスには3つのステップがあり、Ubuntuでシェルスクリプトを使用してこれを処理したいと思います。 forループを使用しています。

私の問題はファイル名です。例は A2013290123000.L1A_LAC.Ireland.hdf です。

変数を作成できます。

DATE=A2013
DATE1=`date +%j` #gives me the number of days since jan 1st 2013 in example above this would be 290
.L1A_LAC.Ireland.hdf part of the name doesn't change.

私の問題は上記の例の名前の中間部分です:123000

名前のこの部分にはパターンはありません。タイムスタンプですが、ファイルごとに異なります。

私のスクリプトに次の変数を作成したいと思います。

TIMESTAMP=$DATE$DATE1$DATE2

ここで DATE2= ファイル名の中間部分です。

この変数を次のワイルドカードとして指定できますか?

DATE2=$*

変数の値が欲しいです。TIMESTAMP= A2013209123000

#!/bin/sh

#set -e

set -x #debug mode

<<comment
export OCSSWROOT=/home/seadas/seadas-7.0/ocssw
source $OCSSWROOT/OCSSW_bash.env
export PATH=$PATH:/home/seadas/seadas-7.0/bin
comment

DATE=A2013
DATE1=`date +%j`
DATE2=$*
TIMESTAMP=$DATE$DATE1$DATE2
LOCATION_NAME=Ireland

DATADIR=/home/MODIS
L2_DIR=/home/MODIS/L2
GEO_FILE_DIR=/home/MODIS/GEO
L1B_DIR=/home/MODIS/L1B
SCRIPTDIR=/home/seadas/seadas-7.0/ocssw/run/scripts
FILTERDIR=/home/seadas/seadas-7.0/ocssw/run/data/common
FUNCTION=/home/seadas/seadas-7.0/ocssw/run/bin/linux_64

HDFFILE=$TIMESTAMP.L1A_LAC.$LOCATIONNAME.hdf
GEOFILE=$LOCATION_NAME-$TIMESTAMP.GEO
LACFILE=$TIMESTAMP.L1B_LAC
HKMFILE=$TIMESTAMP.L1B_HKM
QKMFILE=$TIMESTAMP.L1B_QKM
L2FILE=$TIMESTAMP.L2.hdf


for i in `ls -r $DATADIR`

do
    echo "Start a Process for file $i";

'Generating geolocation file' $SCRIPTDIR/modis_GEO.py -d $DATADIR/$HDFFILE -o $GEO_FILE_DIR/$TIMESTAMP.GEO --threshold=95;

'Generating L1B file' $SCRIPTDIR/modis_L1B.py $DATADIR/$HDFFILE $GEO_FILE_DIR/$TIMESTAMP.GEO -o $L1B_DIR/$LACFILE -k $L1B_DIR/$HKMFILE -q $L1B_DIR/$QKMFILE;

'Generating L2 product'$FUNCTION/l2gen ifile=$L1B_DIR/$LACFILE geofile=$GEO_FILE/$TIMESTAMP.GEO par=$FILTERDIR/msl12_defaults.par ofile=$L2_DIR/$L2FILE resolution=-1 l2prod="default,sst,qual_sst,qual_sst4,sstref,sst4" filter_opt=0 proc_ocean=1 gas_opt=15;

echo "it $i is finished..." 

    echo "\n"
done

ベストアンサー1

期待どおりに動作しません。

  • ls通常、ファイル名に特殊文字(質問に該当しないスペースなど)が含まれていると失敗するため、結果を繰り返さないでください。
  • 既存のHDFファイルを繰り返し、ファイル名からタイムスタンプを抽出します。

    # assuming you do not have whitespaces etc. in filenames
    for i in $DATADIR/$DATE$DATE1*.L1A_LAC.$LOCATIONNAME.hdf ; do
      if [ ! -f "$i" ] ; then  #check if pattern could be expanded
           break ; 
      fi
      HDFFILE="$i"
      TIMESTAMP=$(basename "$i" ".L1A_LAC.$LOCATIONNAME.hdf")
      GEOFILE=$LOCATION_NAME-$TIMESTAMP.GEO
      LACFILE=$TIMESTAMP.L1B_LAC
      HKMFILE=$TIMESTAMP.L1B_HKM
      QKMFILE=$TIMESTAMP.L1B_QKM
      L2FILE=$TIMESTAMP.L2.hdf
    
      # process $i
      # [...]
    

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