2行目の構造値

スクリプトを実行した後、次の行を取得します。

 PyMOL(TM) Molecular Graphics System, Version 1.4.1.
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    Created by Warren L. DeLano, Ph.D. 

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    Enter "help" for a list of commands.
    Enter "help <command-name>" for information on a specific command.

 Hit ESC anytime to toggle between text and graphics.

 Command mode. No graphics front end.
 Detected 8 CPU cores.  Enabled multithreaded rendering.
PyMOL>align MHC1, MHC2
 Match: read scoring matrix.
 Match: assigning 385 x 384 pairwise scores.
 MatchAlign: aligning residues (385 vs 384)...
 ExecutiveAlign: 3810 atoms aligned.
 Executive: RMS =    0.000 (3810 to 3810 atoms)
PyMOL>sele EP1, chain M
 Selector: selection "EP1" defined with 63 atoms.
PyMOL>sele EP2, chain R
 Selector: selection "EP2" defined with 64 atoms.
PyMOL>rms_cur EP1 and n. CA, EP2 and n. CA
 Executive: RMS =    7.457 (9 to 9 atoms)
 PyMOL: normal program termination.

「実行：RMS = 7.457（9〜9原子）」行から「7.457」の値を抽出する必要があります。 「7.457」値と「9～9原子」の情報はラウンドごとに異なるため、パターンとして使用することはできません。 「Executive：RMS」は変更できませんが、上記の行の一部を繰り返します。明らかに私はいつも2番目から最後の行に値を入れます。これを使用して値を抽出できますが、Pythonまたはシェルスクリプトを使用して値を抽出する方法がわかりません。

誰でも私を助けることができますか？とても感謝しています！

しかし、私が作業しているスクリプトは次のとおりです（RMSD値を取得する特定のPyMolプログラムです）。

## RUNNING
## Importing PyMol files
from pymol.cgo import *
from pymol import cmd
from pymol import stored
# Loading MHC1
cmd.load ("MHC1.pdb")
#Change chain C to chain M (MHC1 epitope)
cmd.alter (('chain C'),'chain="M"')
# Loading MHC2
cmd.load ("MHC2.pdb")
#Change chain C to chain R (MHC2 epitope)
cmd.alter (('chain C'),'chain="R"')
## Align MHC1 and MHC2
cmd.do ("align MHC1, MHC2")
## MHC1 epitope selection (EP1)
cmd.do ("sele EP1, chain M")
## MHC2 epitope selection (EP2)
cmd.do ("sele EP2, chain R")
## Remove chain names (this is required so 'rms_cur' will work properly)
cmd.alter (("all"),'chain=""')
## Residues numbers aligned (this is required so 'rms_cur' will work properly)
cmd.alter (("all"),'segi=""')
## RMSD Calculation between EP1 and EP2
cmd.do ("rms_cur EP1 and n. CA, EP2 and n. CA")