昨日も同様の質問をしました(複数回表示される列識別子を含む2つのテーブルのマージ)しかし、独自の行の問題に直面しました。
列1に基づいて2つのテーブルをマージしたいと思います。
ファイル1:
1 今日
1 緑
2 明日
3 赤
ファイル2:
1 多く
1 時々
2 仕事で
2 家で
2 時々
3 新しい
4 多く
5 時々
6 仕事で
期待される出力(ファイル3):
1 今日たくさん
1 今日時々
1 緑 時々たくさん
1 緑 時々
2 明日 出勤
2 明日 自宅で
2 明日 時々
3 赤鳥
私は次のことを思い出しました。
awk -F '[\t]' -v OFS='\t' '{i=$1;$1=x} NR==FNR{A[i]=$0;next} A[i]{print i,$0A[i]}' file2 file1 > file3
しかし、それは私にのみ提供します:
1今日の時々
2時々明日
3赤い鳥
前のスレッド(joinとawk)のソリューションは、2つのファイルの組み合わせ(すべての行を含む)を提供します。ファイル1の行(列1を識別子として)だけを含めたいのですが、ファイル2のすべての一致を報告します。
編集する:
タブで区切られた列
実際のファイル1:fig | 395961.4.peg.2627細菌南細菌不明
(1列:図... 2列:バクテリア... 3列1795)
実際のファイル2:fig | 1000561.3.peg.1838システイン脱硫酵素(EC 2.8.1.7)テスト - チアミン補助因子、ビタミン、補欠分子団、色素
(1列:図…2列:システイン…3列テスト…)
ベストアンサー1
私はPerlでこれをします:
#!/usr/bin/env perl
use strict;
my (%file1,%file2);
## Open the 1st file
open(A,"file1");
while(<A>){
## Remove trailing newlines
chomp;
## Split the current line on tabs into the @F array.
my @F=split(/\t/);
## This is the tricky part. It adds fields 2-last
## to the hash $file1. The value of this hash is an array
## and the keys are the 1st fields. This will result in a list
## of all 1st fields and all their associated columns.
push @{$file1{$F[0]}},@F[1..$#F];
}
## Open the 2nd file
open(B,"file2");
while(<B>){
## Remove trailing newlines
chomp;
## Split the current line on tabs into the @F array.
my @F=split(/\t/);
## If the current 1st field was found in file1
if (defined($file1{$F[0]})) {
## For each of the columns associated with
## this 1st field in the 1st file.
foreach my $col (@{$file1{$F[0]}}) {
print "$F[0]\t$col\t@F[1..$#F]\n";
}
}
}
(長い)1行に入力できます。
$ perl -lane 'BEGIN{open(A,"file1"); while(<A>){chomp; @F=split(/\t/);
push @{$k{$F[0]}},@F[1..$#F];} }
$k{$F[0]} && print "$F[0]\t@{$k{$F[0]}}\t@F[1..$#F]"' file2
1 today green a lot
1 today green sometimes
2 tomorrow at work
2 tomorrow at home
2 tomorrow sometimes
3 red new
大容量ファイルで作業している場合は、しばらく実行してみてください。