>私は、各配列名が次の行の対応する配列を使用して識別される大きなタンパク質配列ファイルを持っています。
はい（引用符を無視）：
>YAL003W EFB1 SGDID:S000000003, Chr I from 142174-142253,142620-143160, Genome Release 64-1-1, Verified ORF, "Translation elongation factor 1 beta; stimulates nucleotide exchange to regenerate EF-1 alpha-GTP for the next elongation cycle; part of the EF-1 complex, which facilitates binding of aminoacyl-tRNA to the ribosomal A site"
MASTDFSKIETLKQLNASLADKSYIEGTAVSQADVTVFKAFQSAYPEFSRWFNHIASKAD
EFDSFPAASAAAAEEEEDDDVDLFGSDDEEADAEAEKLKAERIAAYNAKKAAKPAKPAAK
SIVTLDVKPWDDETNLEEMVANVKAIEMEGLTWGAHQFIPIGFGIKKLQINCVVEDDKVS
LDDLQQSIEEDEDHVQSTDIAAMQKL*
ほとんどの名前テキストを削除して、次のように見せたい（引用符を無視）。
>YAL003W EFB1
MASTDFSKIETLKQLNASLADKSYIEGTAVSQADVTVFKAFQSAYPEFSRWFNHIASKAD
FDSFPAASAAAAEEEEDDDVDLFGSDDEEADAEAEKLKAERIAAYNAKKAAKPAKPAAK
SIVTLDVKPWDDETNLEEMVANVKAIEMEGLTWGAHQFIPIGFGIKKLQINCVVEDDKVS
LDDLQQSIEEDEDHVQSTDIAAMQKL*
名前は1行だけで計算されますが、シーケンスは複数行で計算されるため、私の質問です。この問題をどのように解決できますか？
ベストアンサー1
奇妙なソリューション
$ awk '/>/ { print $1, $2; next } { print }' aa
>YAL003W EFB1
MASTDFSKIETLKQLNASLADKSYIEGTAVSQADVTVFKAFQSAYPEFSRWFNHIASKAD
EFDSFPAASAAAAEEEEDDDVDLFGSDDEEADAEAEKLKAERIAAYNAKKAAKPAKPAAK
SIVTLDVKPWDDETNLEEMVANVKAIEMEGLTWGAHQFIPIGFGIKKLQINCVVEDDKVS
LDDLQQSIEEDEDHVQSTDIAAMQKL*
- />/1行で検索>
- next; awkファイルからパターンが読み込まれなくなりました。