gzipで圧縮されたfastqファイルをマージする方法は？ 1巻も読んで2巻も読んでみたけど
zcat file_1.fastq.gz file_2.fastq.gz | gzip > combined.fastq.gz
しかし、それは私に同じではない読み取り数を与えます。なぜ？
別の方法がありますか？
ベストアンサー1
2つのファイルを結合（接続）するには、以下を使用しますcat。
$ cat file1 file2 >file3
これらの圧縮形式の構造により、これは、およびgzip（他の項目も可能）を使用してbzip2圧縮されたファイルにも適用されます。xz
たとえば、2つの圧縮されたFastaファイル（またはリンクする2つの圧縮ファイル）があるとします。
$ gzcat file1.fa.gz
>seq1
ACTACTACTACTACTACTACTACTACT
$ gzcat file2.fa.gz
>seq1
GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAAAAA
解凍または再圧縮せずに組み合わせた。
$ cat file1.fa.gz file2.fa.gz >file3.fa.gz
結果は結合された圧縮ファイルです。
$ gzcat file3.fa.gz
>seq1
ACTACTACTACTACTACTACTACTACT
>seq1
GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAAAAA
何らかの方法で誤ったデータが提供された場合は、元のファイルの1つ（またはその両方）にエラーがある可能性があります。