次のCSVファイルがあります。
1st 2nd 3rd 4th
ID ... Res Res Res Res (other columns) ...
RZ_AUTO_1, 1cx0, C118, B, C119, B, A165, B, A166, B, CC/AA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_2, 1drz, C118, B, C119, B, A165, B, A166, B, CC/AA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_3, 1ffk, C208, 0, G209, 0, A665, 0, A666, 0, CG/AA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_4, 1ffk, C2767, 0, C2682, 0, G2679, 0, A2681, 0, CC/GA Naked ribose-zipper
RZ_AUTO_5, 1ffk, G2574, 0, C2575, 0, G2798, 0, A2776, 0, GC/GA Single ribose-zipper
私がしたいのは、行（First_Residue（3番目のフィールド）とSecond_Residue（$ 5）の数字が連続している）と（Third_Residue（$ 7）とFourth_Residue（$ 9）の数字が連続している）を抽出することです。出力例は次のとおりです。
RZ_AUTO_1, 1cx0, C118, B, C119, B, A165, B, A166, B, CC/AA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_2, 1drz, C118, B, C119, B, A165, B, A166, B, CC/AA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_3, 1ffk, C208, 0, G209, 0, A665, 0, A666, 0, CG/AA Canonical ribose-zipper
4行と5行は残りの数字が連続していないため削除されます。
awkまたはsedを使用してこれをどのように実行できますか？
ベストアンサー1
比較する各フィールドに数字以外のプレフィックス文字（例ではCなどA）がある場合は、awkから直接数値サブストリングを抽出して比較できる必要があります。
$ awk -F"[ \t,]+" 'substr($5,2)+0==substr($3,2)+1 && substr($9,2)+0==substr($7,2)+1' file.csv
RZ_AUTO_1, 1cx0, C118, B, C119, B, A165, B, A166, B, CC/AA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_2, 1drz, C118, B, C119, B, A165, B, A166, B, CC/AA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_3, 1ffk, C208, 0, G209, 0, A665, 0, A666, 0, CG/AA Canonical ribose-zipper