2列の値が等しい場合、1列の差を出力

awk '
    function to_seconds(hms,     t) {
        split(hms, t, /:/)
        return (t[1]*3600 + t[2]*60 + t[3])
    }
    $2 in times {print to_seconds($1) - times[$2], $2}
    {times[$2] = to_seconds($1)}
' << DATA
19:32:19        4599544
19:32:22        4599544
19:33:07        4599545
19:33:11        4599545
19:33:58        4599546
19:34:01        4599546
DATA

3 4599544
4 4599545
3 4599546