列から拡張子を削除する

awkを使用してください：

awk -F'.' '{print $1}' file

-Fオプションは、デフォルトのフィールド区切り文字（スペース）をドット（.）に変更します。
$1フィールド位置のインデックス。（フィールド区切り記号を使用）。

{ILMN_1343291    TGTGTTGAGAGCTTCTCAGACTATCCACCTTTGGGTCGCTTTGCTGTTCG  NM_001402}.{5}
                  ^^ field index is $1                                          ^^$2

revとawkの使用：

rev file | awk -F'.' '{print $2}'|rev # reverse characters of each lines,\
                                        print field number 2 with (.) separator \
                                        and reverse the result again

このrevユーティリティは、指定されたファイルを標準出力にコピーし、各行の文字順序を逆に置き換えます。ファイルを指定しない場合は、標準入力を読み込みます。

sedを使用してください：

sed 's/.[0-9]*$//' file

sed 's/.[^.]*$//' file

$線の終わりを指します。最初の sed コマンドで char(.) の後にゼロ個以上の数字が続くことを検索し、空白に置き換えます。

2番目のsedコマンドは、（.）の後のすべての内容を削除し、ドット（。）自体も削除します。

revとsedを使用してください。

rev file| sed 's/.*[.]//' |rev

ドット（.）の前にあるすべての項目を含めて削除します。

grepを使用してください：

grep -oP '.*(?=\.[0-9])' file

    -o、--matchのみ
          一致する行の一致する（空でない）部分のみを印刷します。
          これらの各セクションは別々の出力ラインにあります。
    -P, --perl-正規表現
          PATTERNをPerl互換正規表現（PCRE）として解釈する

(?=pattern)：前方予測：前方予測構造は一対の括弧で構成され、左括弧の後に疑問符と等号が続きます。

.*(?=\.[0-9])：（順方向予測）は、パターン（）を一致するもの.*ではなく、点（.）と数字が続くすべての項目（）と一致します。\.[0-9]

revとgrepを使用してください。

rev file |grep -oP '(?<=[0-9]\.).*' |rev

rev file |grep -oP '[0-9]\.\K.*' |rev

(?<=pattern)：アクティブリアビュー。一対の括弧。左括弧の後に疑問符、「より小さい」記号、等号が続きます。

(?<=[0-9]\.).*（前方に戻る）数字の後に来て、ドット（.）で終わるすべての項目と一致します。

\K2番目のgrepコマンドでは、lookbehindアサーションの代わりにniftyを使用できます。

ストリップ切断：

cut -f1 -d. file

cut -c 1-77 file # Print first 77 characters of each line.

cut - ファイルの各行から部分を削除します。

-d, --delimiter=削除
      フィールド区切り文字としてTABの代わりにDELIMを使用してください。

-f, --fields=リスト
      次のフィールドのみを選択してください。

-c, --char=リスト
      この文字だけを選択してください

whileループを使用してください：

while read line; do echo "${line::-2}";done <file

各行の末尾に長さが1の数字だけがあり、長さが固定されている場合に機能します。上記のコマンドは、入力ファイルの各行の末尾にある最後の2文字を削除します。代替コマンドはです${line%??}。